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항생제 부작용 등으로 대장 내 병균이 과다 증식해 대장염이나 중증 설사 등을 일으키는 환자의 대장에 건강한 사람의 대변 속 장내세균을 이식하여 환자 장내세균의 조성과 분포를 정상으로 회복시키는 치료법.